Relación de centros de la Consellería de Educación donde impartió clases
Conservatorio Profesional de Música de Pontevedra
En su actividad como pedagogo, Fernando Vázquez Arias entra a formar parte de la plantilla de profesores del Conservatorio Profesional de Música de Pontevedra, dependiente de la Consellería de Educación de la Xunta de Galicia, en el curso 1993-94, donde continuará en el curso 1994-1995. Impartirá las asignaturas de Historia de la música, Historia del arte, Estética aplicada a la música y piano.
En estos años de permanencia en dicha ciudad, Fernando Vázquez Arias crea, junto al compositor vigués Luis Carro, la Orquesta de Cámara de Pontevedra. Se abrirá una convocatoria a nivel regional para los jóvenes músicos y profesores que quieran formar parte de ella, obteniendo de inmediato una gran respuesta. Los músicos son coordinados durante la semana para las prácticas seccionales y se desplazan desde distintos puntos de Galicia para los ensayos generales los domingos, por ser el día de la semana que todos tienen libre. Al principio, estos ensayos se realizan en el hall del conservatorio antiguo. En ese momento se entra en contacto con el concejal de educación y cultura del ayuntamiento, José María Picallo, y se le explica el proyecto, consiguiendo la cesión del Teatro Principal, de titularidad municipal, para llevar a cabo los ensayos y conciertos.
Para dar contenido a la orquesta y a la vez brindar una oportunidad a los compositores gallegos de estrenar sus obras, se abre otra convocatoria dirigida a los creadores para que pongan música a poemas para solistas líricos y orquesta de cámara. Estas obras se estrenarán en el concierto del mes de mayo de 1995, en el Teatro Principal, con un lleno absoluto. Fue grabado en directo por la RTVG.
Conservatorio Profesional de Música en Ourense
Durante el curso 1995-1996, imparte clases en el Conservatorio Profesional de Música en Ourense, donde enseñará las asignaturas de Solfeo y Armonía.
Conservatorio Profesional de Música de Lugo
En el curso 1996-1997, permanece en el Conservatorio Profesional de Música de Lugo, donde imparte, de nuevo, Historia de la Música, Historia del Arte, Estética aplicada a la música y Conjunto coral, e inicia las clases de Práctica orquestal del centro.
Conservatorio Superior de Música de A Coruña
En septiembre de 1997, renuncia a impartir las clases de Historia en el conservatorio de Lugo para centrarse en la composición, y en octubre de ese mismo año es nombrado profesor de Armonía, Contrapunto, Fuga, Composición e Instrumentación en el Conservatorio Superior de Música de A Coruña. En 1998, la pianista y directora del conservatorio, Natalia Lamas, le encarga formar una orquesta sinfónica de profesores y alumnos como una actividad extraescolar. Entre los cursos 2004-2005 y 2006-2007, asumirá de manera oficial la asignatura de Orquesta, donde llevará a cabo una intensa labor de promoción de la orquesta, del centro y del alumnado, invitándolos a participar en conciertos grabados en calidad de solistas invitados.
Conservatorio Profesional de Música de A Coruña
Entre los años 2007 y 2018, da clases de Fundamentos de composición en el Conservatorio Profesional de Música de A Coruña. Durante esta época, realiza una intensa actividad como compositor y director, estrenando numerosas obras de su autoría: conciertos para instrumentos solistas, cantatas, música de cámara y su ópera A Raiña Lupa.
Conservatorio Superior de Música de A Coruña
En el año 2019, la Xunta de Galicia convoca un concurso de méritos para impartir las clases de Dirección de orquestaen el Conservatorio Superior de Música de A Coruña en calidad de catedrático interino. Lo gana y asume a la vez la dirección del coro y de la orquesta sinfónica del centro, donde permanece hasta el año 2022.